MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 30469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019560	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	425788639
2	NC_019560	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	425788639
3	NC_019560	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788639
4	NC_019560	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	425788639
5	NC_019560	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788639
6	NC_019560	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	425788639
7	NC_019560	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	425788639
8	NC_019560	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788639
9	NC_019560	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425788639
10	NC_019560	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	425788639
11	NC_019560	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788640
12	NC_019560	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788640
13	NC_019560	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788640
14	NC_019560	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	425788640
15	NC_019560	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788640
16	NC_019560	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	425788640
17	NC_019560	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788640
18	NC_019560	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	425788641
19	NC_019560	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788641
20	NC_019560	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788641
21	NC_019560	CTG	2	6	1043	1048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425788641
22	NC_019560	CCG	2	6	1049	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788641
23	NC_019560	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425788641
24	NC_019560	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425788641
25	NC_019560	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	425788641
26	NC_019560	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	425788641
27	NC_019560	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788641
28	NC_019560	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	425788641
29	NC_019560	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	425788641
30	NC_019560	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788641
31	NC_019560	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425788641
32	NC_019560	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	425788641
33	NC_019560	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	425788641
34	NC_019560	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788641
35	NC_019560	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788641
36	NC_019560	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788641
37	NC_019560	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788642
38	NC_019560	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	425788642
39	NC_019560	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	425788642
40	NC_019560	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	425788642
41	NC_019560	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	425788642
42	NC_019560	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	425788642
43	NC_019560	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788642
44	NC_019560	GCT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425788642
45	NC_019560	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	425788642
46	NC_019560	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788642
47	NC_019560	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788642
48	NC_019560	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788642
49	NC_019560	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	425788642
50	NC_019560	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788642
51	NC_019560	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788642
52	NC_019560	CT	3	6	2170	2175	0 %	50 %	0 %	50 %	425788642
53	NC_019560	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	425788642
54	NC_019560	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	425788642
55	NC_019560	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	425788642
56	NC_019560	A	8	8	2541	2548	100 %	0 %	0 %	0 %	425788643
57	NC_019560	TCTT	2	8	2557	2564	0 %	75 %	0 %	25 %	425788643
58	NC_019560	T	7	7	2637	2643	0 %	100 %	0 %	0 %	425788643
59	NC_019560	T	7	7	2679	2685	0 %	100 %	0 %	0 %	425788643
60	NC_019560	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425788643
61	NC_019560	GC	3	6	2790	2795	0 %	0 %	50 %	50 %	425788643
62	NC_019560	A	6	6	2828	2833	100 %	0 %	0 %	0 %	425788643
63	NC_019560	ATTAA	2	10	2924	2933	60 %	40 %	0 %	0 %	425788643
64	NC_019560	AG	3	6	2947	2952	50 %	0 %	50 %	0 %	425788643
65	NC_019560	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788643
66	NC_019560	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788643
67	NC_019560	CAAA	2	8	3100	3107	75 %	0 %	0 %	25 %	425788643
68	NC_019560	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788643
69	NC_019560	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788643
70	NC_019560	TGC	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425788644
71	NC_019560	GAAA	2	8	3247	3254	75 %	0 %	25 %	0 %	425788644
72	NC_019560	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	425788644
73	NC_019560	TG	3	6	3429	3434	0 %	50 %	50 %	0 %	425788644
74	NC_019560	GTT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788644
75	NC_019560	GCGATA	2	12	3726	3737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425788644
76	NC_019560	CAAG	2	8	3823	3830	50 %	0 %	25 %	25 %	425788644
77	NC_019560	A	6	6	3866	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	425788644
78	NC_019560	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788644
79	NC_019560	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425788644
80	NC_019560	TGG	2	6	5148	5153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788645
81	NC_019560	GCTT	2	8	5197	5204	0 %	50 %	25 %	25 %	425788645
82	NC_019560	T	6	6	5203	5208	0 %	100 %	0 %	0 %	425788645
83	NC_019560	ATTC	2	8	5224	5231	25 %	50 %	0 %	25 %	425788645
84	NC_019560	CATT	2	8	5268	5275	25 %	50 %	0 %	25 %	425788645
85	NC_019560	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788645
86	NC_019560	TGG	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788645
87	NC_019560	A	6	6	5500	5505	100 %	0 %	0 %	0 %	425788645
88	NC_019560	GTT	2	6	5590	5595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
89	NC_019560	TAA	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788645
90	NC_019560	TTA	2	6	5717	5722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788645
91	NC_019560	GTG	2	6	5786	5791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788645
92	NC_019560	GTGC	2	8	5846	5853	0 %	25 %	50 %	25 %	425788645
93	NC_019560	TCT	2	6	5930	5935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788645
94	NC_019560	ATG	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788645
95	NC_019560	AGT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788645
96	NC_019560	T	6	6	6055	6060	0 %	100 %	0 %	0 %	425788645
97	NC_019560	AGA	2	6	6136	6141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788645
98	NC_019560	CGA	2	6	6213	6218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425788645
99	NC_019560	AC	3	6	6277	6282	50 %	0 %	0 %	50 %	425788645
100	NC_019560	CTT	2	6	6384	6389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788645
101	NC_019560	TAG	6	18	6411	6428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788645
102	NC_019560	TGT	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
103	NC_019560	GTT	2	6	6490	6495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
104	NC_019560	TTG	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
105	NC_019560	CAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788645
106	NC_019560	TTG	2	6	6664	6669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
107	NC_019560	CCG	2	6	6726	6731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788645
108	NC_019560	ATCG	2	8	6814	6821	25 %	25 %	25 %	25 %	425788645
109	NC_019560	GCT	2	6	6841	6846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425788645
110	NC_019560	CGTT	2	8	6849	6856	0 %	50 %	25 %	25 %	425788645
111	NC_019560	GTT	2	6	6880	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
112	NC_019560	T	6	6	6922	6927	0 %	100 %	0 %	0 %	425788645
113	NC_019560	A	6	6	6988	6993	100 %	0 %	0 %	0 %	425788645
114	NC_019560	GA	8	16	7027	7042	50 %	0 %	50 %	0 %	425788645
115	NC_019560	T	7	7	7052	7058	0 %	100 %	0 %	0 %	425788645
116	NC_019560	CAT	2	6	7363	7368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788646
117	NC_019560	GCC	2	6	7369	7374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788646
118	NC_019560	TCT	2	6	7430	7435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788646
119	NC_019560	GAAACC	2	12	7478	7489	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	425788646
120	NC_019560	AAT	2	6	7528	7533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788646
121	NC_019560	CTT	2	6	7536	7541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788646
122	NC_019560	TTCA	2	8	7606	7613	25 %	50 %	0 %	25 %	425788646
123	NC_019560	CAT	2	6	7626	7631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788646
124	NC_019560	GC	3	6	7673	7678	0 %	0 %	50 %	50 %	425788646
125	NC_019560	ATG	2	6	7679	7684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788646
126	NC_019560	TCA	2	6	7703	7708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788646
127	NC_019560	CG	3	6	7738	7743	0 %	0 %	50 %	50 %	425788646
128	NC_019560	CCG	2	6	7757	7762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788646
129	NC_019560	CTT	2	6	7776	7781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788646
130	NC_019560	TCA	2	6	7811	7816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788646
131	NC_019560	T	6	6	7825	7830	0 %	100 %	0 %	0 %	425788646
132	NC_019560	AG	3	6	7885	7890	50 %	0 %	50 %	0 %	425788646
133	NC_019560	TCTT	2	8	7900	7907	0 %	75 %	0 %	25 %	425788646
134	NC_019560	CAT	2	6	7980	7985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788646
135	NC_019560	GTG	2	6	8012	8017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788646
136	NC_019560	TTC	2	6	8092	8097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788646
137	NC_019560	CCG	2	6	8111	8116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788646
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